Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMC4Q7Z404 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMC4Q7Z404 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMC4Q7Z404 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMC4Q7Z404 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC4Q7Z404 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC4Q7Z404 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC4Q7Z404 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC4Q7Z404 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMC4Q7Z404 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms