Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms