Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms