Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP43Q70EL4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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