Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP31Q70CQ4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP31Q70CQ4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
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