Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP34Q70CQ2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP34Q70CQ2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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