Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC141Q6ZP82 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC141Q6ZP82 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms