Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMBR1LQ6UX01 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBR1LQ6UX01 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms