Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM46CQ5VWP2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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