Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms