Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMPD1Q5SYB0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms