Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms