Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms