Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms