Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BSXQ3C1V8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BSXQ3C1V8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BSXQ3C1V8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms