Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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