Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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FOXD1Q16676 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD1Q16676 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD1Q16676 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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