Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIK5Q16478 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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