Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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ZFHX3Q15911 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZFHX3Q15911 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZFHX3Q15911 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZFHX3Q15911 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZFHX3Q15911 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ZFHX3Q15911 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ZFHX3Q15911 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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