Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms