Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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