Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TRADDQ15628 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TRADDQ15628 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TRADDQ15628 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRADDQ15628 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRADDQ15628 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRADDQ15628 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TRADDQ15628 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRADDQ15628 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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