Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SEC23BQ15437 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SEC23BQ15437 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SEC23BQ15437 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SEC23BQ15437 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SEC23BQ15437 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SEC23BQ15437 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SEC23BQ15437 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SEC23BQ15437 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SEC23BQ15437 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEC23BQ15437 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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