Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPRKQ15262 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRKQ15262 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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