Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM29Q14134 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms