Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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