Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL9A3Q14050 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A3Q14050 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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