Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms