Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CUL4AQ13619 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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