Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCIRG1Q13488 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms