Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5R2Q13319 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms