Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms