Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIAQ12857 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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