Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms