Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD47Q08722 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD47Q08722 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD47Q08722 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD47Q08722 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD47Q08722 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD47Q08722 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD47Q08722 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms