Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms