Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms