Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms