Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC5Q00444 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms