Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP2C1P98194 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms