Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD1P98174 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD1P98174 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD1P98174 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD1P98174 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms