Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRX6P78412 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRX6P78412 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRX6P78412 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRX6P78412 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRX6P78412 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRX6P78412 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRX6P78412 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms