Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARF6P62330 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARF6P62330 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARF6P62330 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms