Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms