Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms