Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5CP51148 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB5CP51148 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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