Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GSK3BP49841 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms