Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NESP48681 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NESP48681 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NESP48681 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NESP48681 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NESP48681 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NESP48681 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NESP48681 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NESP48681 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NESP48681 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NESP48681 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NESP48681 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NESP48681 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NESP48681 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NESP48681 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NESP48681 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NESP48681 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NESP48681 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NESP48681 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NESP48681 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NESP48681 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NESP48681 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NESP48681 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NESP48681 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms