Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNPDA1P46926 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA1P46926 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms