Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACADSBP45954 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms